دعم برنامج الجندر في الصحة والتنمية بلدان إقليم شرق المتوسط لتحقيق العدالة الصحية بين الجنسين. والهدف هو توفير الصحة للجميع. وتزيد البرامج والسياسات الصحية المعنية بالجندر والعدالة بين الجنسين تغطية وفعالية تقديم الخدمة الصحية لجميع الذكور، والإناث، والصبيان، والفتيات، عن طريق تحديد احتياجاتهم وأوجه القصور المختلفة أمامهم والتصدي لها لبلوغ أفضل مستوى للصحة.
وتشتمل أعمال برنامج الجندر في الصحة على تعزيز القدرات المؤسسية والوطنية، والتأهب، وآليات صياغة وتنفيذ ورصد السياسات والاستراتيجيات والخطط الصحية المعنية بالمساواة بين الجنسين. وهناك وظيفة أخرى أساسية للبرنامج وهي زيادة المعلومات والبينات لتحقيق الجندر والعدالة الصحية بين الجنسين.